研究发现患者失语的恢复依赖于左侧半球梗死灶及周围残留的语言区功能的激活，以及右侧半球的语言镜像区言语功能网络的重建，rTMS研究亦表明右侧半球在患者语言恢复中起重要的代偿作用。失语患者的fMRI显示右侧半球语言镜像区存在过度兴奋现象。低频rTMS刺激右侧镜像区皮质可抑制这种过度兴奋，从而有利于言语功能网络重组。
研究表明脑卒中后吞咽功能恢复有赖于正常脑半球代偿功能的建立，扩大脑未损伤区联络范围是促进吞咽功能恢复的一个重要方面；加强对脑皮质感觉信息输入是一个潜在的吞咽障碍治疗手段。高频rTMS刺激健侧前外侧运动皮质和中央前沟运动前区可有效促进吞咽相关评价指标的改善。
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